南云忠一下令攻击的同时，下令侦察机起飞，搜索美军航母编队。结果呢，重巡洋舰利根号的2架侦察机因为弹射器故障晚起飞了半个小时，承担中途岛东北方向搜索侦察任务的重巡洋舰筑摩号上起飞的1架侦察机起飞后引擎发生故障，中途返航，等于是向中途岛东北方向搜索侦察的任务没有落实。

  这天清晨，从天际掠来的日军舰载机群对中途岛美军空军基地、港口展开了狂轰滥炸。早有准备的中途岛美军战斗机当即起飞迎敌，与日军战斗机编队展开了厮杀。于此同时，中途岛美军岸基轰炸机也全数起飞，迎向了日军机动编队，对日舰展开轰炸。